Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM109Q9BVC6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM109Q9BVC6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms