Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LARP6Q9BRS8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LARP6Q9BRS8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LARP6Q9BRS8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms