Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MGME1Q9BQP7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MGME1Q9BQP7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MGME1Q9BQP7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms