Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SMIM7Q9BQ49 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM7Q9BQ49 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms