Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNKPQ96T60 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PNKPQ96T60 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PNKPQ96T60 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms