Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CRBNQ96SW2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRBNQ96SW2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRBNQ96SW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms