Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC38A2Q96QD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC38A2Q96QD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms