Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NSMCE3Q96MG7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NSMCE3Q96MG7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms