Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C12orf66Q96MD2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C12orf66Q96MD2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C12orf66Q96MD2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms