Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CFAP53Q96M91 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CFAP53Q96M91 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CFAP53Q96M91 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms