Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNIP3Q96KP6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNIP3Q96KP6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNIP3Q96KP6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms