Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MS4A4AQ96JQ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MS4A4AQ96JQ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MS4A4AQ96JQ5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms