Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED3Q96IU2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED3Q96IU2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED3Q96IU2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
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