Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCARF2Q96GP6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCARF2Q96GP6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms