Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MRPL53Q96EL3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MRPL53Q96EL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms