Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RMDN1Q96DB5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RMDN1Q96DB5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RMDN1Q96DB5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms