Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPTSSAQ969W0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SPTSSAQ969W0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms