Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCC1Q92922 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCC1Q92922 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCC1Q92922 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms