Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT35Q92764 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT35Q92764 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms