Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HERVK_113Q902F9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HERVK_113Q902F9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms