Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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FAT3Q8TDW7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
FAT3Q8TDW7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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