Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KLHDC4Q8TBB5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KLHDC4Q8TBB5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KLHDC4Q8TBB5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms