Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APPL2Q8NEU8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APPL2Q8NEU8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APPL2Q8NEU8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms