Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LINC00116Q8NCU8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LINC00116Q8NCU8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms