Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC63Q8NA47 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC63Q8NA47 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms