Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RHOT1Q8IXI2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHOT1Q8IXI2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms