Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOT2Q8IXI1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHOT2Q8IXI1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms