Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLF2Q8IX21 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLF2Q8IX21 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF2Q8IX21 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF2Q8IX21 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF2Q8IX21 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLF2Q8IX21 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms