Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC83Q8IWF9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC83Q8IWF9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC83Q8IWF9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms