Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IGDCC3Q8IVU1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGDCC3Q8IVU1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms