Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM228AQ86W67 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM228AQ86W67 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms