Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.54■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
UBE3BQ7Z3V4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBE3BQ7Z3V4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms