Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OTOP2Q7RTS6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OTOP2Q7RTS6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms