Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTF1AQ7RTS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTF1AQ7RTS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms