Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYS1Q717R9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYS1Q717R9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYS1Q717R9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms