Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM43BQ6ZT52 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM43BQ6ZT52 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms