Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC129Q6ZRS4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC129Q6ZRS4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms