Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC137Q6PK04 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC137Q6PK04 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms