Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LETMD1Q6P1Q0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LETMD1Q6P1Q0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms