Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDC42EP5Q6NZY7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CDC42EP5Q6NZY7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms