Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC8

PPP1R18, Phostensin, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R18Q6NYC8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPP1R18Q6NYC8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPP1R18Q6NYC8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPP1R18Q6NYC8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms