Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
REEP3Q6NUK4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
REEP3Q6NUK4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms