Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP1BQ659C4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP1BQ659C4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms