Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
RNF123Q5XPI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RNF123Q5XPI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms