Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF18Q5VWM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF18Q5VWM3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms