Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
C12orf60Q5U649 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
C12orf60Q5U649 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C12orf60Q5U649 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms