Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP170Q5SW79 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
CEP170Q5SW79 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CEP170Q5SW79 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms