Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPANXN3Q5MJ09 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPANXN3Q5MJ09 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms