Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9I0

TFDP3, Transcription factor Dp family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFDP3Q5H9I0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFDP3Q5H9I0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFDP3Q5H9I0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms