Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR3Q5GH77 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR3Q5GH77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms